安庆重镇的丢失
太平天国高层对安庆的得失十分在意。不仅陈玉成急赴安庆，洪仁玕、林绍璋、黄文金等人都各自统军来援。
湘军方面当然早有心理和物质准备，曾国荃、杨载福、鲍超诸将率军在集贤关、棋盘岭、菱湖等地截堵太平军援军。
曾国荃在安庆周围的部署很扎实，建造无数坚碉固堡，层层设防，目的就是使得安庆城内外的太平军不能相通。如果太平军里应外合，清军会陷入被人反包围的窘境。
功夫不负有心人，由于太平军外援进不来，清军殊死进攻，赤岗岭大据点终于为清军攻克，四千多太平军被杀，安庆城外丧失了一个重要屏障。
紧接着，菱湖北岸与南岸的太平军营垒相继失守。这样一来，陈玉成的援军失去凭依，更为被动，基本与安庆城内的太平军隔绝往来。气恼之余，陈玉成与洪仁玕合军后，从桐城方向连营二十余里，分数路大军进攻包围安庆的清军，均不克，无功而返。
不久，由于黄文金生力军驰至，陈玉成又组织新的大规模进攻。不料湘军勇猛异常，在外拒太平军援军的同时，向内对从安庆城冲出的太平军守军发动反击，最终牢牢控制安庆战场的主动权。
弹尽粮绝情况下，安庆终于于1861年9月5日被清军用地雷炸毁城墙后攻克。太平军守将叶芸来与手下两万多将士皆在接阵中被杀。
可恨的是，湘军陷安庆后，在城内大杀无辜百姓，把全城财物抢掠一空。
安庆之失，原因诸多，从大方面讲，太平军失误如下：
其一，太平军“二次西征”的战略毫无新意，其实就是抄袭二破江南大营那次的“围魏救赵”之法，即几路军合击武昌，攻清军空虚之地，基本谋略是想诱调安徽境内清军出境回救武汉，以缓安庆之围。
对此，曾国藩一眼看穿这是太平军“抄写前文”之策。太平军谋略之陈旧，使得清军沉着应付。加上太平军诸路在武昌未能果断进攻，牵制和诱引安徽清军的计划完全落空。
其二，二破江南大营后，李秀成等人倾意东进，陈玉成部也在东线滞留，西线的湘军从容进逼，进围安庆，二次西征为时已晚，已经种下安庆之失的败因。而且，李秀成固执己见，坚持从长江南岸进发，洪秀全要他“扫北”，二人相拗，内部不谐。
其三，太平军各自为政，各自为战，在军力占极大优势的情况下，没有像样的统一指挥，“巨掌”化为“散指”，轻举妄动，率意出击，散漫后退，而作为主力军之一的李秀成部竟然在武昌兜绕一圈后扬长而去，完全置安庆于不顾。
反观湘军，曾国藩一统指挥大权，江南江北清军协调一致，步调一致，未雨绸缪，最终毕功于安庆。
其四，陈玉成等人心急，犯了速战速决的冒失错误。此举正让安庆周围清军从容不迫地施行围城打援战略，一口一口吃掉太平军来援之军。陈玉成急躁求成，直接进攻安庆，人肉终不敌深沟高垒和密集的枪林弹雨，一挫再挫，最终反攻为守，自困愁城。不仅安庆失掉，他本人性命也失掉。
假设陈玉成当时能冷静下来，不恃气、不凭威，在从外线凭优势兵力对安庆等地围城清军采取大包围的同时，率先进攻太湖一带的胡林翼部清军（都是新募的没有经验的新兵），继攻桐城挂车河一带清军，安庆城外的清军势必会撤围反顾。
如此一来，清军先前精密的内外壕垒完全丧失作用，反而会受太平军牵制，处处落入被动挨打局面。但历史总是不能假设。
安庆援战失败后，陈玉成部自此大走下坡路。他从集贤关撤退，奔往庐州。当时，部将赖文光劝他迅速与苗沛霖、张乐行等人联手，出奇兵四处，进取荆襄。陈玉成不听，反而上表天京，要求封部将陈得才、赖文光等人为王，分军去陕西，最终目的是让这些人在一路开辟过程中重新整出一支大军，再回来夺取安庆。
由此，庐州只有陈玉成一支孤军留守。
天京方面，深居简出的洪秀全听说安庆失守，勃然大怒，立刻下令把陈玉成、洪仁玕革职。李秀成由于当时在江浙一带发展得不错，又攻下杭州，所以躲过了这些倒霉事，不用为二次西征的失败负责。
洪仁发、洪仁达等人落井下石，在洪秀全面前极力打压洪仁玕等人，至此，洪氏亲族帮重新在天京掌权。不仅如此，为了“鼓舞”士气，弱化李秀成、李世贤兄弟的威权，洪秀全开始了始无前例的大肆封王——一下子封了二千七百多个王！
特别是洪秀全两个哥哥重掌大权后，只要有人送钱送物，只要是广西“老人”，只要有亲戚裙带关系，无不为王。封王太多，无可再封之下，太平天国的洪秀全又创制一字用于封爵，意思是“准王爷”，导致“人心更不服，多有他图”。（李秀成语）
当然，据黄文英在自述中称，太平天国王爷虽多，其实还是分等级的：
那天朝的王有五等：若从前的东、西、南、北四王，翼王，现在的干王，执掌朝纲，是一等王；若英王、忠王、侍王，执掌兵权，是二等王；若康王、堵王、听王，会打仗的，是三等王；若我与恤王是四等王；那五等王一概都叫列王。起初是有大功的才封王，到后来就乱了，由广东跟出来的都封王，本家亲戚也都封王，捐钱粮的也都封王，竟有二千七百多王。
但是，毕竟是二千七百多个，分封太滥，上至70岁在天王府中管钥匙的“工友”董金泉得封“梦王”，下至洪仁发几十天大的儿子洪金元得封“同王”。太平天国后期真是“王爷满地走，丞相不如狗”，个个爵位“显赫”得吓人。
陈玉成方面，由于受到处分，年轻人一时想不开，心烦意乱，枯守孤城。
洪秀全恨陈玉成不争气，在1862年初就下令催他与扶王陈得才会兵为天京取粮。但是，当时陈得才、赖文光等人早已经进入河南，不可能在远途行军过程中及时赶回。
得知清将多隆阿率大军来围攻庐州，陈玉成着急，给捻军张乐行和陈得才等人发急信，希望他们伸手来援，但信件均为清军截获。至此，庐州的陈玉成所部情势十分危急。