多极质谱进行蛋白质多肽测序的原理是什么

根据一级质谱可以测得多肽整体的分子量，多肽碎裂时会产生一系列在肽链不同位置断裂而形成的碎片离子，可以得到多肽的二级谱图，根据二级质谱相近谱峰之间的质量数之差可以推算出对应的氨基酸序列。

分离不同质荷比的带电基团，每级质谱都会产生新的碎片并且能筛选一次（通过高温氮气碰撞），通过对照谱库的特征离子来确定样品的情况。