奇迹小说
蛋白质网络建模及预测

蛋白质网络建模及预测

作者: 彭小清

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已完结现代当代当代文学
作品简介

蛋白质组学是当前生命科学的新前沿,通过研究蛋白质的功能、结构、相互作用来系统地分析蛋白质,进而分析生命活动,成为热点的研究问题之一。尤其是,从蛋白质网络中进行多物种的关键蛋白识别、蛋白质复合物挖掘、以及蛋白质功能预测,对揭示蛋白质网络的组成结构、预测蛋白质功能、解释特定的生物进程具有重要的研究意义。本书一方面讲述利用蛋白质活性的动态性、蛋白质的亚细胞定位信息,构建精准的蛋白质相互作用网络的方法。另一方面,以此为基础,讲述从新的角度研究生物信息学中与蛋白质相关的几个重要问题,其中包括适用于多物种的关键蛋白识别、蛋白质复合物挖掘、以及蛋白质功能预测。

目录 (70章)
倒序
正文
第1章绪论1.1蛋白质相互作用1.2蛋白质网络1.3关键蛋白质1.4蛋白质复合物1.5蛋白质功能1.6本书的主要内容和组织结构第2章蛋白质网络研究现状2.1基于蛋白质表达动态性的动态蛋白质网络2.2基于多状态下表达及相关性变化的动态蛋白质网络第3章动态蛋白质网络的构建方法3.1动态蛋白质网络的构建方法3.2实验结果及分析(1)3.2实验结果及分析(2)3.3本章小结第4章亚细胞区间蛋白质网络的构建4.1亚细胞区间蛋白质网络4.2加权蛋白质网络4.3本章小结第5章蛋白质复合物识别的相关研究5.1基于密度和局部搜索的算法5.2基于层次聚类的算法5.3交叠复合物挖掘的算法5.4融合多元数据的蛋白质复合物识别5.5动态蛋白质网络中的蛋白质复合物识别第6章基于蛋白质复合物形成机制与蛋白质活性的蛋白质复合物提炼方法6.1蛋白质复合物的形成机制以及内部活性特征6.2蛋白质复合物提炼方法6.3实验与分析6.4本章小结第7章融合蛋白质亚细胞定位信息的蛋白质复合物识别7.1密度-扩散中心性7.2中心性得分的幂律分布检验7.3基于幂律分布的双层聚类算法7.4实验与分析7.5讨论7.6本章小结8.1概述8.2基于k层网络的蛋白质复合物识别算法8.3实验结果及分析8.4讨论8.5本章小结第9章关键蛋白质研究现状9.1基于拓扑特性的关键蛋白质识别方法9.2融合其他生物信息的关键蛋白质识别方法第10章基于亚细胞区间蛋白质网络的关键蛋白质识别10.1基于亚细胞区间蛋白质网络的关键蛋白质识别方法10.2评价指标10.3实验结果10.4讨论10.5本章小结第11章基于亚细胞区间重要性的关键蛋白质识别方法11.1基于亚细胞区间重要性的中心性方法11.2实验结果11.3本章小结第12章蛋白质功能预测研究现状12.1蛋白质功能预测的重要性12.2预测蛋白质功能的难点12.3蛋白质功能预测问题12.4蛋白质功能预测研究现状12.5蛋白质功能预测的评价方法13.1引言13.2蛋白质功能预测方法LSDC(1)13.2蛋白质功能预测方法LSDC(2)13.3实验结果13.4本章小结第14章蛋白质网络研究的挑战与机遇14.1识别可靠的PPI面临的挑战14.2特定上下文的动态蛋白质网络的构建14.3整合组学中的蛋白质相互作用
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